Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms