Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAB39Q9Y376 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms