Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DTX4Q9Y2E6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms