Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF5Q9Y2D1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms