Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms