Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPSEQ9Y251 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms