Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms