Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM35Q9UPQ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms