Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms