Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPO2Q9UMS6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms