Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms