Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP4Q9UKK3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms