Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED13Q9UHV7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED13Q9UHV7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms