Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms