Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4Q9UBX2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms