Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms