Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFIP11Q9UBB9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms