Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC2Q9P258 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCC2Q9P258 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms