Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC180Q9P1Z9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms