Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms