Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN6Q9NWW5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms