Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT57Q9NWB7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT57Q9NWB7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms