Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSDC1Q9NW68 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms