Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms