Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEPPQ9NTK1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms