Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms