Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms