Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms