Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms