Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms