Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms