Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms