Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms