Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3Q9H3W5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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