Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms