Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP44Q9H0E7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms