Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms