Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms