Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC2Q9C0B9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms