Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms