Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms