Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms