Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms