Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL3Q9BXA9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms