Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106CQ9BVX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106CQ9BVX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms