Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHD1Q9BUP0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms