Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAGR1Q9BTK6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAGR1Q9BTK6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms