Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms