Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R9BQ96SB3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R9BQ96SB3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms