Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms